Jérôme Le Saux

6 Sentier des basses pointes
92190 Meudon

Tél : 06.61.97.10.17
Mail : mailto:jlesaux(at)free(dot)fr
Web : http://Jlesaux.free.fr

33 ans célibataire

Ingénieur Informaticien

Développement logiciel

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EXPERIENCE PROFESSIONNELLE

2009

Ingénieur Concepteur Développeur Chez Bouygues Telecom .

Ré-implémentation d'un outil de routage des trafics du Coeur de réseau (Looping C# Dot Net)

  • Changement de l'agorithme de routage (implémentation de l'agorithme de Dijkstra, OSPF)
  • Refonte de l'application avec le modèle plugin
Réorganisation de l'architecture des systèmes d'information du groupe

2008

Ingénieur Concepteur Développeur Chez Bouygues Telecom .

Evolutions d'un simulateur de congestion des réseaux capillaires, ajout des nouvelles technologie 3G. (C# .NET)

Développement d'un Framework métier en Dot Net, migration d'outil VBA vers technologie Dot Net

2006 - 2007

Responsable informatique de l'intégration de pyroséquenceurs (GS20, GSFLX) au sein de la procédure interne.

Gestion du flux de données de la machine de production jusqu'au Lims et machines de calculs. (Scripts Bash,perl et C++).

2004

Installation, gestion et développements autour de l'environnement SRS (version 8.1.1.4).

Ajout au sein de l'environnement de données internes ne suivant pas de modèles existants (Icarus, JSP). Ecriture des parseurs de fichier et des modéles.

2005 - 2007

Gestion de projet d'assemblage (Bash, C, C++, Mysql, JBPM). Développement d'outils de calcul sur des clusters True64.

Automatisation et gestion (JBPM) du processus de finition d'ORF.  Chaque étape encapsule un programme (C ou C++) ou un script de décision (script Bash, perl). La persistance des données se fait à travers une base de données relationnelles PostgresSQL.

2004

Développement de l'interface web de ré-annotation MICHECK, Microbial genome checker.(PHP, AWK, BASH).

2002

Ingénieur bioinformaticien dans l'UMR 8030 (structure et évolution des génomes), localisé au Génoscope à Evry. Concéption de la base de données PKGDB (Mysql) et de son interface (PHP, Perl, C). Développement de l'interface web de prédictions de génes AMIGene (Automatic Microbial Gene Annotation).

2000 - 2002

Mise en place d'une plate-forme bioinformatique au centre de recherche des Ulis du laboratoire GlaxoSmithKline, en collaboration avec les groupes de bioinformatique de Stevenage (UK) et d'Harlow (UK) (Perl CGI, C)

  • Mon principal projet a été de mettre en place une procédure automatique pour identifier les protéines sécrétées chez l'Homme. (Perl, Langage C).
  • Développement d'un outil intranet (Perl CGI, Langage C), d'analyse de protéines inconnues (eucaryote), ainsi que formateur à l'utilisation de cet outil
  • Annotateur sur de nouveaux gènes chez l'Homme et participation au procéssus de recherche de ces nouveaux génes (Perl)

2000 - 2002

Mise en place d'une base de donnees de séquences asujetties à l'épissage alternatif (Mysql, PHP et Langage C), pour le laboratoire ABISS (Rouen).

1996 - 2000

Technicien de laboratoire dans le laboratoire Génétique et Membranes à l'Institut Jacques Monod (Paris)




FORMATION

2007

Formation "Programmation efficace et avancée en C++" par la société Valtech Training - La Défense

2006

Formation "Analyse et conceptions avec UML" par la société Valtech Training - Evry

2002

DESS EGOISt (Etude des Génomes Outils Informatiques et Statistiques) à l'Université de Rouen

2000

Maîtrise de Biochimie à l'Université Denis Diderot (PARIS VII)



COMPETENCES BIOLOGIQUES

Biochime :

  • Biochime : enzymatique et structurale
  • Génétique : mendélienne, cellulaire, moléculaire et génomique
  • immunologie
  • Modélisation mathématiques de phénomènes biologiques
  • Pilotage d'un fermenteur Bioflo 3000 (New Brunswick), culture en continu
  • Techniques d'analyse en Biochimie (électrophorése, immunoblot, cinétiques enzymatiques, spectrofluorimétrie, spectrophotométrie et phosphor Imager)
  • Traitements des données expérimentales sur PC et Machintosh avec différents type de logiciels (Image Quant, Excel, NIH, Kaleidagraph, Cricket Graph)

COMPETENCES BIOINFORMATIQUES

  • Comparaison de séquences : Blast, Fasta, Lassap
  • Alignement multiple : ClustalW, dbClustal
  • Détection de gènes : GenScan, GeneMark, HMM
  • Détection de peptide signal : SignalP
  • Détection de domaines transmembranaires : TMHMM
  • Phylogénie : Phylip
  • Usage des codons : CodonW
  • Modélisation moléculaire : Sybil

COMPETENCES INFORMATIQUES

  • Algorithmique : alignement de séquences, tri, recherche de motifs, TDA (graphes, arbres, automates)
  • Langages de programmation : C, perl, JAVA, SQL, PHP, AWK, C++, C#, Objective C
  • API/Frameworks:POSIX, STL, GTK2, Java swing, JBOSS Redhat, JBPM, .NET Framework, Apple Cocoa (Appkit, Foundation, etc...)
  • Conception et développement de sites web : HTML, CGI (MySQL, PHP, perl CGI)
  • Conception logiciel : RUP (Rational Unified Process, Processus Unifié)
  • Autres langages : Matlab, getz(SRS), Icarus(SRS), langage R, UML
  • Systémes d'exploitation : IRIX, Linux, SOLARIS, OSF1, MacOS X
  • Matériel: Macintosh, PS, SUN
  • Utilisation de banque de données biologiques (EMBL, Trembl, Swissprot, Pfam, Genebank, Subtilist, Prosite, BlastProdom, Prints)
  • Statistique de l'usage des codons : modèles Markoviens, AFC, Clustering.




Compétences Linguistiques

Anglais

Lu, parlé, écrit (nombreux séjours en Angleterre)

Espagnol

Notions scolaires completées par de nombreux séjours




Informations complémentaires
  • Pratique du hockey sur glace (depuis 1988)
  • Navigation nautique, sport aquatiques
  • Photo ( numérique et argentique, diffusion web )
  • Titulaire du permis B (disposant d'un vehicule personnel)